Hoodwinked! fue uno de los primeros largometrajes de animación por computadora financiados completamente de forma independiente, financiado por el empresario Maurice Kanbar después de que viera un cortometraje en DV llamado Wobots realizado por el director Cory Edwards.

Kanbar inicialmente quería una versión de Cenicienta o Pinocho, pero los hermanos Edwards presionaron por Caperucita Roja, y la idea de estructurar la historia como una investigación criminal desde múltiples perspectivas provino de Todd Edwards, inspirado por dramas criminales no lineales como Rashomon, Pulp Fiction, Run Lola Run y Memento.

Kanbar aceptó financiar completamente la película sin ni siquiera ver un guión terminado, y originalmente planeaba lanzarla directamente en DVD.

Para ahorrar dinero, el elenco original estaba compuesto principalmente por amigos y familia de los cineastas, incluyendo al director Cory Edwards a sí mismo prestando su voz a Twitchy (acelerada 50% usando Pro Tools), su esposa prestando su voz a una reportera zorrilla, y la hija joven de un productor prestando su voz al pájaro carpintero Quill.

El personaje Japeth la cabra fue escrito específicamente para Benjy Gaither, hijo de los cantantes de música gospel Bill y Gloria Gaither y amigo de la infancia de los hermanos Edwards; las proyecciones de prueba con niños del vecindario convencieron a los cineastas de mantener el personaje en la película a pesar de considerar eliminarlo.

Cuando la Weinstein Company se unió tarde en la producción, reemplazaron varios papeles principales con nombres más reconocidos -- Anne Hathaway reemplazó a Tara Strong como Red, Glenn Close reemplazó a Sally Struthers como Abuela, Jim Belushi reemplazó a David Ogden Stiers como el Leñador, y Chazz Palminteri reemplazó a Tom Kenny como Woolworth -- pero como la animación ya estaba mayormente terminada, los nuevos actores tuvieron que reproducir exactamente las líneas e improvisaciones de los actores originales, sin crédito para estos últimos.

Para reducir costos, la animación fue producida durante tres años por un pequeño equipo inexperto en un estudio llamado Digital Eye Candy ubicado en una casa rentada en Manila, Filipinas, con efectos visuales y composición subcontratados a Prana Studios en Bombay, India.

Debido a que no podían igualar la calidad fotorrealista de las películas de CG de los grandes estudios, los cineastas deliberadamente diseñaron la película para que pareciera animación en stop-motion, citando a Rankin-Bass y El extraño mundo de Jack como inspiraciones, dando a Red solo cuatro dedos e hiciendo que uno de los ojos del Leñador fuera más grande que el otro para lograr una apariencia de muñeca hecha a mano.

Detective Nicky Flippers y su perro compañero fueron añadidos a la historia como un homenaje a The Thin Man después de que un productor notara similitudes entre la trama de la película y la franquicia Thin Man de los años 30-50; el personaje del Lobo también fue modelado según el reportero de tono imperturbable de Chevy Chase en Fletch.