Tras el éxito de Shrek 2 en 2004, el CEO de DreamWorks Animation Jeffrey Katzenberg planeó un arco narrativo de cinco películas que comenzaría con el primer Shrek y terminaría con un quinto capítulo.

A diferencia de las dos primeras películas, este capítulo no fue dirigido por Andrew Adamson, ocupado con Las crónicas de Narnia: El león, la bruja y el armario; Adamson permaneció involucrado como productor ejecutivo, dando consejos sobre el estado de la película aproximadamente cada cuatro meses.

La película fue desarrollada con el título provisional Shrek 3, luego cambió a Shrek the Third en marzo de 2006 porque los directores querían darle su propia identidad en lugar de hacerla parecer un simple secuela.

El estreno de la película estaba originalmente planeado para noviembre de 2006, pero fue trasladado a mayo de 2007 para maximizar los ingresos y hacer coincidir el lanzamiento en DVD con la época navideña; la película Flushed Away ocupó el lugar de noviembre de 2006.

En el doblaje italiano de la tercera película, el Gato con Botas es doblado por el mismo Antonio Banderas, mientras que en la película anterior la voz italiana era del doblador Massimo Rossi.

Al comienzo de la película, en el teatro-restaurante del Príncipe Azul, se revela que el ruido de los cascos de los caballos es producido por cocos, el mismo gag utilizado en Monty Python and the Holy Grail, película que también protagonizaban John Cleese y Eric Idle.

Eric Idle abandonó la premier de la película molesto por el gag de los cocos, que consideraba un plagio de Monty Python and the Holy Grail, y amenazó con demandar a los productores, aunque luego regresó a la sala después de calmarse.

Shrek the Third recaudó 38 millones de dólares en el primer día de programación, el mejor debut diario para una película de animación hasta entonces, récord superado solo tres años después por Toy Story 3.

La película ostentó el récord del mejor fin de semana de apertura para una película de animación durante nueve años, hasta que fue superado por Finding Dory en 2016.

En la banda sonora aparece una versión de Live and Let Die de Paul McCartney, cantada por un grupo de ranas durante la escena del funeral del rey Harold, una elección que algunos críticos encontraron extraña.

Debido a la decisión de Paramount de interrumpir la producción en HD DVD, Shrek the Third permanece como la única película de DreamWorks Animation que fue distribuida en ese formato.