La serie fue anunciada el 4 de febrero de 2008 como un spin-off contemporáneo de The Suite Life of Zack & Cody, ambientado en un crucero de lujo; el presidente de Disney Channel, Gary Marsh, explicó que tras 88 episodios de la serie original querían mostrar a los personajes en un escenario completamente nuevo.

Con la ampliación de la segunda temporada a más de trece episodios, el elenco alcanzó 138 episodios de media hora consecutivos, convirtiéndose en los personajes de mayor continuidad en la historia de Disney Channel hasta ese momento; la franquicia llegó finalmente a 162 episodios, un récord que se mantuvo durante años.

Doc Shaw se incorporó al elenco en la segunda temporada como Marcus Little, pero se apartó durante la tercera temporada debido a su compromiso con la serie de Disney XD Pair of Kings.

La serie se rodó en los Hollywood Center Studios de Los Ángeles, los mismos estudios donde se grabó la serie original, y se grabó frente a un público en vivo, aunque se utilizó una pista de risas grabada para algunas escenas.

The Suite Life on Deck fue la última serie de Disney Channel en debutar emitiéndose exclusivamente en definición estándar y la primera de tres series del canal en transicionar a alta definición, cambio que se produjo el 7 de agosto de 2009 con el estreno de la segunda temporada, 'The Spy Who Shoved Me'.

El tema principal, 'Livin' the Suite Life', fue escrito por John Adair y Steve Hampton (quienes también compusieron los temas de The Suite Life of Zack & Cody, Phil of the Future y Wizards of Waverly Place) e interpretado por el cantante británico Steve Rushton, quien solo recibió crédito por interpretar el tema en la segunda temporada.

El episodio crossover 'Double-Crossed' (parte de la trilogía 'Wizards on Deck with Hannah Montana' con Wizards of Waverly Place y Hannah Montana) fue visto por más de 10.6 millones de espectadores, convirtiéndose en el programa más visto de la noche tanto en TV por cable como en abierto, y fue el episodio en que Cody y Bailey tuvieron su primera cita.

En noviembre de 2023, el episodio 'When in Rome...' se volvió viral en redes sociales porque Zack y Cody intentaban reservar una mesa en un restaurante italiano para una fecha que resultó coincidir exactamente con el 16 de noviembre de 2023.

En 2013, Dylan Sprouse reveló en una entrevista con Gawker que él y su hermano habían propuesto a Disney Channel continuar la serie con Zack y Cody regresando al Hotel Tipton de Boston para convertirse en mentores de un niño; Disney rechazó la idea inicialmente y una versión posterior, con los gemelos mudándose a un hotel de Miami y Selena Gomez como protagonista, fue rechazada por los Sprouse al no recibir créditos de productores.