El anime de Pokémon nació gracias al éxito del manga publicado en la revista CoroCoro Comic casi al mismo tiempo que el lanzamiento del videojuego; el subdirector de la revista, Masakazu Kubo, impulsó ante Nintendo la creación de la serie animada con el apoyo de Koji Kawaguchi y Tsunekazu Ishihara.

Los derechos originales del anime pertenecen a seis empresas: Nintendo, Creatures, Game Freak, TV Tokyo, Shogakukan-Shueisha Productions y JR East Japan Planning, mientras que la animación corre a cargo del estudio OLM.

Aunque en los videojuegos el jugador elige entre Bulbasaur, Charmander o Squirtle como Pokémon inicial, el equipo de producción decidió que Ash comenzara con Pikachu para ampliar el público objetivo de la serie hacia las niñas.

Los nombres japoneses de Ash (Satoshi) y su rival Gary (Shigeru) están tomados en homenaje a Satoshi Tajiri y Shigeru Miyamoto, creadores de los videojuegos Pokémon.

Según el guionista Shōji Yoshikawa, el trío del Team Rocket (Jessie, James y Meowth) está fuertemente influenciado por el trío de villanos 'Sandaiakuma' de la serie 'Time Bokan'.

El episodio 38, titulado 'Dennō Senshi Porygon', emitido el 16 de diciembre de 1997, provocó el llamado 'shock Pokémon', un incidente que causó convulsiones en numerosos espectadores japoneses y obligó a suspender la emisión de la serie durante más de cuatro meses.

El episodio 33, 'La gran carrera de Pokémon de fuego', emitido el 11 de noviembre de 1997, alcanzó el rating más alto de toda la serie con un 18,6% de audiencia en la región de Kanto.

La producción del anime se realizó originalmente con animación en cel (celuloide) hasta que en agosto de 2002 se pasó a la animación digital; a partir de la última parte de 'Advanced Generation' se comenzó a usar CGI para representar los movimientos de los Pokémon.

Tras la muerte del narrador original Unshō Ishizuka, quien narró la serie desde 'Pocket Monsters' hasta el episodio 91 de 'Sun & Moon', el papel fue asumido por Kenyu Horiuchi a partir del episodio 95.

En marzo de 2023 concluyó la etapa de la serie protagonizada por Ash y Pikachu tras 26 años y un total de 1240 episodios; en abril de ese mismo año se estrenó una nueva serie con los personajes protagonistas Liko y Roy (Horizontes Pokémon).