La scénariste Deborah Davis a écrit la première version, intitulée The Balance of Power, en 1998, sans avoir aucune expérience en scénarisation au-delà de ses études du soir à l'école de cinéma.

La productrice Ceci Dempsey a dû lutter pendant près d'une décennie pour trouver un financement pour le film, car les financiers pensaient que son contenu lesbien et l'absence de représentation masculine seraient difficiles à commercialiser.

Le réalisateur Yorgos Lanthimos a été engagé pour le projet par le producteur Ed Guiney, impressionné par le film nominé aux Oscars Dogtooth, et Lanthimos a ensuite travaillé en étroite collaboration avec Tony McNamara pour réécrire le scénario après la lecture du pilote de The Great par McNamara.

Kate Winslet avait été annoncée en 2015 pour jouer Sarah Churchill, mais a été remplacée par Rachel Weisz après que Lanthimos ait également envisagé d'offrir le rôle à Cate Blanchett.

Emma Stone a activement poursuivi le rôle d'Abigail en demandant à son agent de contacter directement Lanthimos, puis l'a supplié de la distribuer après avoir d'abord mal jugé le personnage en le considérant comme une simple victime.

Avant le tournage, Lanthimos a soumis les trois actrices principales à un processus de répétition de trois semaines peu orthodoxe, incluant réciter les dialogues en se nouant en nœuds, sauter entre des carrés de moquette, ou former un « bretzel humain » en se liant les bras.

Le tournage principal s'est déroulé pendant 45 jours au Hatfield House dans le Hertfordshire, avec des scènes supplémentaires représentant le Parlement filmées à la Bodleian Library d'Oxford, et a été reporté d'un an pour permettre à Lanthimos de réaliser d'abord The Killing of a Sacred Deer.

Le directeur de la photographie Robbie Ryan a évité d'utiliser un Steadicam, préférant expérimenter des rigs de gimbal pour obtenir un mouvement de caméra fluide, et a utilisé des objectifs fisheye et ultra grand-angle tout au long du film pour créer une sensation d'isolement et de confinement pour les personnages.

Les costumes contrastant masculin-féminin conçus par la costumière Sandy Powell pour Sarah ont été involontairement inspirés par ses créations antérieures pour Tilda Swinton dans Orlando (1992).

Le film n'a pas de partition originale ; il s'appuie plutôt sur des pièces baroques, romantiques et de musique classique du XXe et XXIe siècles, et le générique de fin s'ouvre avec « Skyline Pigeon » d'Elton John, tiré de son album de 1969 Empty Sky.

Bien que le film dépeigne la Reine Anne gardant obstinément 17 lapins de compagnie en tant que substituts à ses enfants perdus, historiquement les lapins à l'époque étaient considérés comme de la nourriture ou des nuisibles, et non comme des animaux de compagnie, et ce détail est une invention fictive.