Le final de la série a introduit pour la première fois le concept du « Spider-Verse » (multivers Spider-Man), une idée qui a ensuite inspiré de nombreux comics, dessins animés et films Spider-Man au début du XXIe siècle, notamment les longs métrages Spider-Verse produits par Sony Pictures Animation.
Le scénariste principal John Semper a affirmé que cet arc final, intitulé « Spider Wars » (basé sur la seconde Clone Saga des comics), avait inspiré l'histoire « Spider-Verse » de Dan Slott.
Marvel Films Animation, studio nouvellement formé, a produit la série en interne pour la seule fois de son existence, l'animation étant confiée au studio japonais TMS-Kyokuichi.
Selon Semper, Marvel, alors proche de la faillite, n'exerçait aucun contrôle créatif sur la série, tandis que Stan Lee a eu une influence sur les treize premiers épisodes.
John Semper a visionné les précédentes adaptations de Spider-Man pour s'en inspirer, mais seule la série live-action japonaise de 1978 l'a impressionné, la qualifiant de « géniale » et de « divertissement décalé sympathique » ; le robot géant de cette version a influencé l'arc final de la série avec l'univers parallèle où l'alter-ego riche de Spider-Man possède un robot.
Contrairement à une croyance répandue selon laquelle la série aurait été fortement censurée, Semper a clarifié en 2014 que ce n'était pas plus censuré que d'autres séries de l'époque, précisant que la décision que Spider-Man n'utilise pas ses poings venait de lui-même, car il voulait éviter d'enseigner aux enfants à résoudre les problèmes par la violence simple.
Les règles de production interdisaient de montrer des coups de poing, de faire passer des personnages à travers du verre, de mettre des enfants en danger, de montrer des vampires, ou d'utiliser le mot « sinister ».
Pour reproduire fidèlement l'apparence de New York, les illustrateurs de décors ont mené d'importantes recherches visuelles à partir d'archives photographiques aériennes, notamment des toits, et ont consulté des plans pour reproduire fidèlement les bâtiments.
Les cellulos d'animation représentant le Pan Am Building de Manhattan ont dû être jetés une fois terminés, car l'équipe artistique basée en Californie avait appris trop tard que le bâtiment avait reçu une nouvelle enseigne plus d'un an auparavant.
Marvel Films envisageait initialement de réaliser les décors entièrement en images de synthèse pendant les déplacements de Spider-Man en toile, mais des contraintes budgétaires ont contraint la production à utiliser l'animation traditionnelle sur cellulos, avec quelques décors en CGI réalisés par le studio de jeux vidéo Kronos Digital Entertainment.
Le thème musical de la série a été écrit et interprété par Joe Perry, guitariste du groupe Aerosmith, après que le producteur Avi Arad l'a rencontré par hasard lors d'un vol entre New York et Los Angeles et que Perry lui a confié vouloir composer un thème pour une série Spider-Man.
La musique orchestrale de fond était composée par Shuki Levy, Haim Saban et Udi Harpaz, ce dernier étant crédité au générique sous le pseudonyme « Kussa Mahchi », qu'il utilisait aussi pour Mighty Morphin Power Rangers, X-Men et le doublage anglais de Dragon Ball Z ; la musique était enregistrée avec un orchestre en Israël.
Le groupe Aerosmith est référencé dans l'épisode de 1995 « The Alien Costume, Part One », dans lequel Peter se transforme brièvement en membre du groupe.
Le magazine People a qualifié la série comme l'une des meilleures adaptations animées de comic book de tous les temps.
Avec ses 65 épisodes, la série a longtemps détenu le record de la série animée Spider-Man la plus longue, jusqu'à ce qu'Ultimate Spider-Man la dépasse avec 104 épisodes.
En juin 2025, Marvel Comics a annoncé une suite en comics de 5 numéros intitulée « Spider-Man '94 », reprenant le cliffhanger de la fin de la saison 5, bien que John Semper ait confirmé n'avoir eu aucune implication dans ce projet et n'en avoir appris l'existence qu'à son annonce.
