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創作者ドナルド・P・ベリサリオは4年間アメリカ海兵隊に従軍した経験を持ち、テレビ業界で反戦・反軍人的な風潮があると感じていたことから、一貫して親軍的な姿勢のドラマ作りを志向していた。

前作『クオンタム・リープ』の打ち切り後、ベリサリオはユニバーサルからパラマウントに製作拠点を移し、女性パイロットの登場やテイルフック事件の余波を背景に、空母上での殺人ミステリーを描く単発脚本として本作の企画を始めた。

海軍艦艇内の犯罪捜査体制を調べる中で、警察役を担うNCIS特別捜査官と、弁護・検察・現場捜査を兼任できる海軍法務部の軍人弁護士の存在を知ったベリサリオは、物語作りの観点から「探偵、検察官、弁護人を一度に持てる」法務士官を主人公に選んだ。

NBC放送時代は西海岸プレジデントのドン・オルマイヤーがアクション重視の路線を望み、パイロット版でアンドレア・パーカーが演じたヒロインに代えてトレイシー・ニーダムを新たな女性主役として起用させた。

第3シーズン開始時にコストを抑えるため、製作拠点がハリウッドのメルローズ通りにあるパラマウントの撮影所からサンタクラリタのバレンシア・スタジオへ移り、スピンオフのNCISとは第9・10シーズン期に同じ施設で並行して撮影された。

物語の舞台は世界各地に及ぶが、実際の撮影はほぼ南カリフォルニアのロサンゼルス都市圏内で行われ、パークプラザホテルをモスクワのホテルに、エンジェルス国立森林公園をシベリアのタイガに、シュラインオーディトリアムを中東の建物に見立てるなど、既存の建物をロケ地として代用していた。

CGI技術の進歩により、ロケ撮影からヤシの木やカリフォルニアのナンバープレートを消去する作業が容易になり、海外の視聴者から「いつ自分の国で撮影するのか」という問い合わせの手紙が届くほど巧妙に世界各地の設定を再現できていた。

1999年7月12日から14日にかけて、主演のデビッド・ジェームズ・エリオット、キャサリン・ベル、パトリック・ラビオートーらキャストとスタッフが、南カリフォルニア沖の原子力空母USSジョン・C・ステニスに乗り込み、第5シーズン序盤3話分の撮影を行った。

当初アメリカ国防総省の広報部門からの協力は、テイルフック事件の影響で得られなかったが、パラマウント映画のスタジオとしての強みを生かし『トップガン』『ザ・フィナル・カウントダウン』『レッド・オクトーバーを追え』など軍事関連映画のストック映像を使用することで乗り切った。1997年以降は海軍・海兵隊も協力するようになった。

日本語版では、沖縄における米兵少女暴行事件をモデルにしたエピソードが第4シーズン「横須賀の悪夢」として制作されたが、実際の放送映像では沖縄のデモとして韓国のデモ映像が誤って使用された。

オーストラリア海軍少佐ミック・ブランビー役を演じたトレヴァー・ゴダードは2003年6月7日に薬物中毒で死去し、番組ではワルツィング・マチルダをBGMに彼の出演シーンをつなげた追悼映像が放送された。

ローレン・シンガー役を演じたナンシー・チェンバースは、主人公ハーモン役のデビッド・ジェームズ・エリオットと実生活で結婚した。

キャサリン・ベルは、第1シーズン最終話でハーモンにとって妹のような存在だった被害者ダイアン・ショーク海軍中尉役として出演しており、後にシリーズ本編でハーモンの新パートナーとなるマックにこの人物が似ているという設定になっている。

NBCでの第1シーズン最終話ではハーモンが殺人容疑で逮捕される衝撃的な引きで終わったが、CBSへの移籍に伴う仕切り直しにより、いつの間にか釈放された状態で第2シーズンが始まり、日本の視聴者を困惑させた。この疑惑が完全に晴れるエピソードは第3シーズンまで製作されなかった。

番組はNBCで打ち切られた後、ライバル局のCBSが1996年12月に拾い上げてミッドシーズン枠として15話を放送するという、3大ネットワーク間での珍しい移籍を経験した。

最終回のタイトルは「翼に風を受けて（Fair Winds and Following Seas）」で、ハームとマックのどちらが軍務を辞めるかをコインの表裏で決める場面で終わるが、結果は画面がフェードアウトするまで明かされないという、シリーズの伝統的な演出手法が踏襲された。

最終回で示されなかったコイントスの結果は、2019年放送のスピンオフ『NCIS：ロサンゼルス』第10シーズン最終回「フォールス・フラッグ」で、デビッド・ジェームズ・エリオットとキャサリン・ベルが本人役で再出演することで初めて明らかにされた。

2003年当時、本作の視聴者の年齢中央値は58歳で、CBSの他の看板番組『ザ・ガーディアン』と並んで、ゴールデンタイムの全米ネットワーク番組の中で2番目に高い年齢層であった（1位はCBSの『60ミニッツ』）。