J. Michael Straczynski concebeu Babylon 5 combinando duas ideias: uma série ambientada num local fixo (para controlar custos, ao estilo de séries como as passadas em hospitais ou delegacias) e uma saga épica inspirada em obras como a série Fundação, Duna e O Senhor dos Anéis.
Straczynski definiu cinco objetivos para a série: ser boa ficção científica, ser boa televisão, fazer pela ficção científica o que Hill Street Blues fez pelos dramas policiais, ter orçamento razoável e ter uma aparência nunca vista antes na TV.
A Warner Bros. só encomendou a série após o sucesso do telefilme piloto 'The Gathering', exibido em 22 de fevereiro de 1993, mas manteve-se receosa quanto à capacidade do público de acompanhar uma narrativa de longo prazo e ao risco de cancelamento precoce.
Straczynski escreveu 92 dos 110 episódios da série, incluindo a totalidade dos 44 episódios da terceira e quarta temporadas, um feito inédito na televisão americana.
Para cada personagem foi criada uma 'porta de saída' (trap door) narrativa, prevendo a possível saída inesperada de um ator; esse recurso foi usado quando Claudia Christian e Andrea Thompson deixaram o elenco.
Durante a produção da quarta temporada, o fechamento da rede de distribuição Prime Time Entertainment Network deixou a quinta temporada em risco, levando Straczynski a reescrever a quarta temporada para poder concluir toda a trama principal caso a série fosse cancelada.
O episódio final pretendido, 'Sleeping in Light', foi filmado ainda durante a quarta temporada como precaução contra um cancelamento, e só depois de confirmada a quinta temporada foi guardado para ser exibido como o verdadeiro final da série, sendo substituído na quarta temporada por um novo episódio, 'The Deconstruction of Falling Stars'.
Alguns atores tinham dificuldade em lidar com as próteses necessárias para interpretar personagens alienígenas, o que levou os produtores a usar sempre o mesmo grupo de até 12 pessoas para papéis alienígenas de nível médio, ficando conhecido informalmente como o 'Babylon 5 Alien Rep Group'.
A primeira aparição da personagem Anna Sheridan foi interpretada por Beth Toussaint numa mensagem gravada, antes de o papel passar a ser interpretado por Melissa Gilbert.
No episódio 'Atonement' da quarta temporada, os próprios alfaiates e a supervisora de figurino da série aparecem em cena como as mulheres minbari que ajustam o novo uniforme de Zack Allan, numa referência bem-humorada ao antigo uniforme de segurança, difícil de vestir por combinar couro e lã.
Babylon 5 foi uma das primeiras séries de televisão a usar tecnologia computadorizada para criar efeitos visuais em vez de maquetes e miniaturas, principalmente por razões orçamentárias, já que cada episódio custava cerca de 650 mil dólares, contra 1,5 milhão de dólares por episódio de Star Trek: The Next Generation.
Os efeitos visuais foram feitos inicialmente com sistemas Amiga e Video Toaster, e depois com sistemas Pentium, Macintosh e Alpha usando o software LightWave 3D, com as sequências projetadas para simular física newtoniana, especialmente os efeitos da inércia no movimento das naves.
Christopher Franke assumiu a composição da trilha sonora das cinco temporadas depois que Stewart Copeland, responsável pela música do telefilme original, não pôde continuar por compromissos de gravação e turnê.
Babylon 5 foi uma das primeiras séries de ficção científica na televisão a fazer referência explícita a um relacionamento entre pessoas do mesmo sexo, tratando a orientação sexual como algo tão natural quanto ser destro ou canhoto.
No Reino Unido, o Channel 4 exibia os episódios semanalmente sem pausas, o que fez com que os últimos episódios das primeiras temporadas fossem ao ar no Reino Unido antes mesmo dos Estados Unidos, e a série alcançou altos índices de aprovação do público, com o episódio 'Endgame' da quarta temporada superando até as novelas de horário nobre em audiência.
